Após décadas de paz, a corrida pelo poder começa no mundo ninja. As cinco grandes vilas almejam se destacar cada vez mais, enquanto organizações criminosas renascem das sombras. Somente os mais poderosos se destacam, seja no individual ou no coletivo. Uma nova era começa colocando em rota de colisão grandes figuras do mundo ninja, aonde guerras territoriais e políticas se aproximam.

Com as grandes cinco vilas tendo novos comandos, cada uma se estabelece com novos lemas e ambições políticas. As organizações independentes vêem uma oportunidade única surgir com o poder do mundo ninja não estando mais unificado: para muitos estamos na era da ascenção dos nukenins. As poderosas criaturas Bijuus estão espalhadas pelo mundo ninja, dando começo a uma verdadeira busca de poder pela dominação das mesmas, que já não pertencem a nenhuma vila. Escolha seu lado e seus aliados e se prepare para uma nova aventura!